---

Быстро эволюционирующие штаммы рекомбинантного вируса оспы обезьян усугу(xxx)ют проблемы вспышки mpox в 2024 году
sciencedirect
тревожное открытие. наблюдается необычное явление с вирусом Mpox /ранее известным как оспа обезьян/ клада 1b, которая несет ответственность за последнюю вспышку. Исследователи из Auxergen Inc. в Балтиморе, США; Auxergen Srl в Научно-технологическом парке Tecnopolis, Италия; Муниципальной объединенной больницы Гаосюна, Тайвань; и Бюро здравоохранения правительства города Гаосюн, Тайвань, обнаружили, что этот вирусный штамм расходится неожиданно быстрыми темпами. Это расхождение, вызванное генетической рекомбинацией и мутацией, может осложнить усилия по сдерживанию распространения и разработке эффективных методов лечения.
быстрая эволюция Mpox clade 1b
В основе этой эволюции лежит генетический состав clade 1b, который претерпевает то, что ученые называют «рекомбинантными событиями». Рекомбинантные события происходят, когда вирусные геномы смешивают и сопоставляют генетический материал, что приводит к появлению новых вирусных штаммов, которые могут иметь различное поведение, инфекционные возможности или устойчивость к иммунным реакциям. За последние 11 месяцев наблюдалось резкое увеличение рекомбинантных кластеров в пределах Mpox clade 1b, при этом более 10 отдельных рекомбинантных кластеров были идентифицированы в образцах из различных регионов мира, включая Демократическую Республику Конго, Таиланд, Швецию, Кению и Уганду.
Эти события рекомбинации необычны, по сравнению с ранее доминирующей кладой Mpox 2b, которая была ответственна за крупную вспышку в 2022 году. В то время как клада 2b показала ограниченные скорости рекомбинации и мутации, клада 1b, по-видимому, пошла по гораздо более агрессивному пути. Скорость рекомбинации клады 1b почти в 78 раз выше, чем у клады 2b в начальные периоды вспышек, что предполагает более высокую скорость генетических сдвигов в инфицированных популяциях.
Влияние APOBEC3 и генетической мутации
Значительным фактором этой быстрой эволюции может быть влияние мутации гена APOBEC3. APOBEC3 - это фермент, обнаруженный у людей, который обычно нацелен на вирусную ДНК, вызывая мутации, которые препятствуют репликации вируса. Однако в случае клады 1b ученые полагают, что мутация может способствовать генетическим сдвигам вируса, позволяя ему быстро адаптироваться, в ответ на иммунную защиту или другие факторы окружающей среды.
Исследовательская группа изучила 32 последовательности Mpox clade 1b с октября 2023 года по август 2024 года, собранные в сотрудничестве с Глобальной инициативой по обмену всеми данными о гриппе /GISAID/. Филогенетический анализ показал, что clade 1b разделился на 4 отдельные линии и многочисленные подгруппы, 14 из которых были идентифицированы на основе уникальных полиморфизмов тандемных повторов в его генетической последовательности. Для сравнения, clade 2b развил только 11 подгрупп во время вспышки 2022 года, что подчеркивает более высокую частоту мутаций clade 1b.
Рекомбинантные кластеры: растущая проблема
В clade 1b, менее чем за год появилось 10 основных рекомбинантных кластеров. Эти кластеры указывают точки, где геном вируса рекомбинирует, что может привести к новым генетическим вариантам. Известные кластеры включают DRC IRB010, Thailand NIC31, Sweden PHAS11304 и несколько кластеров из Демократической Республики Конго, Уганды и Кении.
Распространенность этих рекомбинантных кластеров предполагает, что события суперинфекции - когда хозяин заражается несколькими вирусными штаммами - вероятно, часты, что увеличивает вероятность генетической рекомбинации. Эта суперинфекция также может объяснить быстрое развитие вариантных подгрупп в пределах клады 1b. Исследователи отметили, что эти рекомбинантные события были обнаружены уже в октябре 2023 года, что свидетельствует о том, что клада Mpox 1b быстро диверсифицировалась, с тех пор, как впервые начала распространяться.
Последствия для общественного здравоохранения и мер контроля
Быстрое расхождение клады 1b вызывает ряд опасений у должностных лиц общественного здравоохранения. При большей рекомбинации и более высоких показателях мутаций существует вероятность того, что вирус может уклоняться от иммунных ответов от предыдущей инфекции или вакцинации /получилось кви №2/, потенциально снижая эффективность существующих методов лечения и профилактических мер. В частности, результаты исследования указывают на то, что текущие усилия по геномному надзору, возможно, должны быть усилены, чтобы идти в ногу с эволюцией вируса.
Дополнительной проблемой является отсутствие достаточного количества генетических последовательностей клады 1b из затронутых стран. Исследователи подчеркнули, что ограниченные лабораторные возможности и инфраструктура тестирования в таких странах, как Демократическая Республика Конго, препятствуют всестороннему генетическому анализу, что потенциально приводит к недооценке фактических показателей мутации и рекомбинации вируса. Этот дефицит данных усложняет усилия по мониторингу и контролю вируса, поскольку каждый новый рекомбинантный штамм может нести неизвестные свойства или факторы устойчивости.
Потенциальные стратегии для улучшения надзора
Эксперты исследования призывают к глобально скоординированным усилиям по геномному надзору, для тщательного отслеживания генетических изменений вируса. Повышение прозрачности в обмене генетическими данными Mpox позволит ученым во всем мире отслеживать поведение вируса и модели адаптации, помогая в разработке целевых стратегий реагирования. Внедряя надежные методы секвенирования и поддерживая прозрачную сеть обмена данными, органы здравоохранения могли бы опережать новые варианты /шиш догонишь/, выявляя потенциальные риски на ранних стадиях и соответствующим образом корректируя вмешательства